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Trascrittoma

Concetto

Trascrittoma (trascrittoma) si riferisce in generale a condizioni fisiologiche, le cellule del set di tutto il prodotto di trascrizione, compreso RNA messaggero, RNA ribosomiale, RNA transfer e RNA non codificante; senso stretto si riferisce a una raccolta di tutti dell'mRNA.

Oggetti

Trascrittoma sequenziamento è generalmente utilizzato poli-timina (oligo-dT) purificato per affinità RNA polimerasi II la trascrizione di un mRNA maturo e ncRNA generato per high-throughput sequencing.

Superiorità

Rispetto alle tradizionali piattaforme di microarray, sequenziamento del trascrittoma senza sonde pre-progettati contro sequenze note, per qualsiasi specie con l'attività trascrizionale generale sono stati individuati, fornendo più accurato il segnale digitalizzato, un throughput più elevato e la rilevazione più ampia campo di rilevamento, è lo studio approfondito della complessità del trascrittoma strumento potente.Scarto

Trascrittoma sequenziamento e le differenze di espressione genica

La tecnologia di sequenziamento del trascrittoma è al mRNA, smallRNA, e RNA non codificanti e di altre tecnologie high-throughput sequencing per testare le loro sequenze. Accesso completo e rapido a una specie particolare in un particolare organo o tessuto in uno stato in quasi tutte le trascrizioni. Che riflette le loro livelli di espressione. Costruzione di espressione genica si riferisce ad uno stato in una data cella o libreria di cDNA di tessuto non-polarizzazione, scala cDNA sequenziamento, frammento di raccolta cDNA sequenza, la composizione qualitativa e quantitativa della popolazione mRNA, e il disegno del particolare cellula o tessuto l'espressione del gene in un particolare stato di specie informazioni abbondanza in modo che compilato la scheda di dati si chiama espressione genica.


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